Current approach to study character of large intestine microbiota in case of rotavirus diarrhea in children

The article presents a current approach л. И. Железова to study the character of large intestine microbiota in case of rotavirus diarrhea in children aged from 2 months to 18 years, who were treated in the period of years 2015-2017 in Pediatric Research and Clinical Centre for Infectious Diseases (Saint Petersburg, Russia), including clinical methods like data collection of clinical and anamnestic information about the patient, analysis of the character of clinical manifestations, sampling of fecal matter for viruses, pathogenic and conditionally pathogenic microorganisms and disbacteriosis, and also selection of paired blood serum samples for RA, reaction of agglutination with autostrains, and laboratory investigations like primary stool culture for acute intestinal infection agents, isolation and identification of etiologically significant strains by mass-spectrometer Bruker (DaltonikMALDI Biotyper, Germany) with identification of antibioticgrams and studying the genetic and phenotypic features of microorganisms, analysis of the contents of large intestine for disbacteriosis, PCR to reveal virus DNA-RNA, study of paired blood serum samples in the dynamics of the disease according to RA with autostrains and identification of the level of local nonspecific secretory A (SIgA) immunoglobulin in stool filtrates. Established the leading role of RVI in the structure of viral diarrhea in children identified age-related features of RV diarrhea as well as the status of the microbiota of the colon with mono-RVI, RVI, associated with virus and RVI, associated with a bacterial process, correlations were found between the severity of RVI in children, the degree of disorder of the microbiota, level D and defined genophenotypic characteristics of microorganisms. The results obtained define the tactics of treatment of children suffering from RVI focuses not only on effective causal and symptomatic therapy, but also for timely recovery of the intestinal microbiota and the level of non-specific secretory immunoglobulin A.

children, acute intestinal infection, viral diarrhea, rotavirus infection, laboratory diagnostics, microbiota

1. Антоненко О. Н. Инфекционная диарея: пути решения проблем терапии / О. Н. Антоненко//Журн. Педиатри. Приложение к журналу «Consilium medicum».- 2011.- № 2.- С. 35-37.

2. Бондаренко В. М. Мацулевич Т. В. Дисбактериоз кишечника как клинико-лабораторный синдром: современное состояние проблемы / В. М. Бондаренко, Т. В. Мацулевич //М.: 2007.-300 с.

3. Железова Л. И. Сравнительная оценка характера нарушений микробиоты при ротавирусной инфекции у детей / Л. И. Железова, А. С. Кветная, К. Д. Ермоленко // International scientific investigations. Сборник статей VI Международной научно-практической конференции «Проблемы и перспективы современной науки», Москва, 2016.

4. Wiegering V. Gastroenteritis in childhood: a retrospective study of 650 hospitalized pediatric patients / Wiegering V [et al.] // International Journal of Infectious Diseases.- 2011.- V. 15.- P. 401-440.

5. Вирусные диареи у детей и взрослых: монография / Под ред. Проф. В. П. Малого.- СПб.-2011.- 104 с.

6. www.epid-oki.ru/cont/analit_pism/ Godovoj_otchet_referens centra. Годовой отчет референс-центра по мониторингу возбудителей острых кишечных инфекций (РЦКИ) за 2013 г.

7. Горелов А. В. Ротавирусная инфекция у детей / А. В. Горелов, Д. В. Усенко // Вопросы современной педиатрии. - 2008.- № 8 (6).- С. 72-78.

8. Дисбиоз кишечника: руководство по диагностике и лечению / Под ред. Е. И. Ткаченок, А. Н. Суворова. СПб: Спецлит. 2007.-238 с.

9. Еженедельный эпидемиологический бюллетень / 01 февраля 2013, 1988-й год № 5, 2013, 88, p. 49-64 http://www. who.int/wer.

10. Железова Л. И. Клинико-лабораторные особенности микроэкологических нарушений слизистой толстой кишки при I острых кишечных инфекциях у детей / Л. И. Железова //Дис.. канд. мед. наук.- СПб. - 2006.- 124 с.

11. Кветная А. С. Микробиологические основы патогенеза пневмококковой инфекции у детей // Дис.докт. мед. наук.- СПб.- 1995. - 248 с.

12. Крамарев С. А. Ротавирусная инфекция: эпидемиология и профилактика / С.А. Крамарев, Л. В. Закордонец // Здоровье ребенка.-2011.- Т. 1 (28).

13. Лобзин Ю. В. Клиника, эпидемиология и профилактика ротавирусной инфекции / Под ред. академика РАМН профессора Ю. В. Лобзина. - СПб.: НИИДИ, 2013.-48 с.

14. Львов Д. К. Ротавирусные инфекции / Д. К. Львов, Л. В. Колобухина // Медицинская вирусология / Под ред. акад. Д. К. Львова. М.: Мед. инфор. Агентство.- 2008.- С. 372-375.

15. Лукьянова А. М. Клинико-эпидемиологическая характеристика вирусных диарей у детей / А. М. Лукьянова, М. К. Бехтерева, Н. Н. Птичникова // Журнал инфектологии.- 2014.- Т. 6.- № 1.- С. 60-66.

16. Мазанкова Л. Н. Микробиоценоз кишечника и иммунитет. / Л. Н. Мазанкова, А. А. Новокшонов, И. А. Майкова // Журн. Детские инфекции. -2007. - Том 6. - № 1.- С. 9-12.

17. Vaccine Era / Mary E. Wikswo [et al.] // Emerging Infectious Disease Journal.- Oct2013 V. 19, № 10.

18. Овсянников Д. Ю. Дисбактериоз кишечника у детей: этиология, клиническое значение, диагностические критерии, современные методы коррекции // Педиатрия. 2011.- № 2.- С. 10-19.

19. Отраслевой стандарт и протокол ведения больных с дисбактериозом кишечника. Тезисы докладов научно-практического семинара «Индивидуальные подходы к проблеме дисбактериоза». М., 2003. С. 3-7.

20. Оришак Е. А. Выявление бактерий и вирусов - возбудителей кишечных инфекций у лиц с дисбактериозом кишечника // Журнал Лаборатория.- 2011.- № 4.- С. 21-22.

21. Покровский В. И. Ротавирусный гастроэнтерит // Инфекц. бол. и эпидемиол. 2007.- № 3.- С. 11-14.

22. Parashar U. D. Rotavirus and severe childhood diarrhea / U. D. Parashar, Gibson C. J., Bresee J. S. Glass R. I. //Emerg. Infect. Dis. - 2006.- № 12.- P. 304-306.

23. Раздьяконова И. В. Клинико-иммунологическая характеристика калицивирусной инфекции у детей и тактика терапии // Автореф. дис.. канд. мед. наук / Раздьяконова И. В.- СПб: СПбГПМА.- 2009.- 21 с.

24. EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing). 2010, 2014, 2017.

25. Тихомирова О. В. Вирусные диареи у детей: особенности клинической картины и тактика диетической коррекции / О. В. Тихомирова, М. К. Бехтерева, И. В. Раздьяконова, О. И. Ныркова // Вопросы современной педиатрии. - 2009.- Т. 8.- № 1.- С. 98-103.