Профили и генетические детерминанты антибиотикорезистентности возбудителей внебольничных инфекций мочевыводящих путей у женщин репродуктивного возраста

Цель исследования. Определить профили и генетические детерминанты антибиотикорезистентности возбудителей внебольничных инфекций мочевыводящих путей (ИМП) у женщин репродуктивного возраста в Санкт-Петербурге.
Материалы и методы. В исследование были включены штаммы микроорганизмов, полученные от 145 женщин репродуктивного возраста с диагнозом ИМП. Чувствительность к антибиотикам исследовали диско-диффузионным методом, интерпретацию результатов осуществляли в соответствии критериями EUCAST. Штаммы уропатогенных энтеробактерий были протестированы методом ПЦР на наличие генов бета-лактамаз: гены бета-лактамаз, кодирующих ферменты группы AmpC (MOX, CMY, LAT, BIL, DHA, ACC, MIR, ACT, FOX), TEM, SHV, OXA-1, генов БЛРС группы CTX–M, генов карбапенемаз (KPC, OXA‑48) и металло-бета-лактамаз (VIM, IMP, NDM).
Результаты. Большинство (81 %) случаев ИМП у женщин в Санкт-Петербурге были обусловлены энтеробактериями с подавляющим доминированием Escherichia coli (66 %). Фосфомицин, меропенем и нитрофурантоин имели самую высокую in vitro активность против уропатогенных энтеробактерий. Были отмечены высокие показатели резистентности к бета-лактамным антибиотикам (от 16 % к цефотаксиму до 28 % к амоксициллин / клавулановой кислоте). Гены ТЕМ-бета-лактамаз были обнаружены в 31 изоляте (26,7 %), SHV – в 17 (14,6 %), СТХ–М типа – в 15 (12,9 %), гена DHA – в 2 (1,7 %). Остальные гены бета-лактамной резистентности (MOX, CMY, LAT, BIL, ACC, MIR, ACT, FOX, группа KPC, группа OXA-подобных, VIM, IMP, NDM) не были выявлены.
Заключение. Микробиологический и молекулярный анализ структуры бета-лактамной резистентности имеет ключевое значение для эффективного эпидемиологического контроля устойчивости возбудителей инфекций мочевыводящих путей к антибактериальным препаратам.

1. Flores-Mireles A.L., Walker J. N., Caparon M., Hultgren S. J. Urinary tract infections: epidemiology, mechanisms of infection and treatment options. Nat. Rev. Microbiol. 2015. Vol. 13. P. 269–284. https://doi:10.1038/nrmicro3432.

2. Ruppé E., Woerther P. L., Barbier F. Mechanisms of antimicrobial resistance in Gram-negative bacilli. Ann. Intensive Care. 2015. Vol. 5. No. 1. P. 61. https://doi:10.1186/s13613-015-0061-0.

3. Сидоренко С. В., Березин А. Г., Иванов Д. В. Молекулярные механизмы устойчивости грамотрицательных бактерий семейства Enterobacteriaceae к цефалоспориновым антибиотикам/ Антибиотики и химиотерапия. 2004. Т. 49. № 3. С. 6–16.

4. Dallenne C., da Costa A., Decré D., Favier C., Arlet G. Development of a set of multiplex PCR assays for the detection of genes encoding important β-lactamases in Enterobacteriaceae. J. Antimicrob. Chemother. 2010. Vol. 65. P. 490–495. https://doi:10.1093/jac/dkp498.

5. Olesen I., Hasman H., Aarestrup F. M. Prevalence of beta-lactamases among ampicillin-resistant Escherichia coli and Salmonella isolated from food animals in Denmark. Microb. Drug Resist. 2004. Vol. 10. No. 4. P. 334–340. https://doi:10.1089/mdr.2004.10.334.

6. Pérez-Pérez F.J., Hanson N. D. Detection of plasmid-mediated AmpC β-lactamase genes in clinical isolates by using multiplex PCR. J. Clin. Microbiol. 2002. Vol. 40. No. 6. P. 2153–2162. https://doi:10.1128/jcm.40.6.2153–2162.2002.

7. Палагин И. С., Сухорукова М. В., Дехнич А. В., Эйдельштейн М. В., Перепанова Т. С., Козлов Р. С. и исследовательская группа «ДАРМИС‑2018». Антибиотикорезистентность возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты многоцентрового исследования «ДАРМИС‑2018». Клин. микробиол. антимикроб. химиотерапия. 2019. Т. 21. № 2. С. 134–146. https://doi:10.36488/cmac.2019.2.134-146.

8. Ny S., Edquist P., Dumpis U. [et al.] Antimicrobial resistance of Escherichia coli isolates from outpatient urinary tract infections in women in six European countries including Russia. J. Glob. Antimicrob. Resist. 2019. Vol. 17. P. 25–34. https://doi:10.1016/j.jgar.2018.11.004.

9. Carattoli A., García-Fernández A., Varesi P. [et al.] Molecular epidemiology of Escherichia coli producing extended-spectrum β-lactamases isolated in Rome, Italy. J. Clin. Microbiol. 2008. Vol. 46. P. 103–108. https://doi:10.1128/JCM.01542-07

10. Fernandes R., Amador P., Oliveira C., Prudêncio C. Molecular characterization of ESBL- producing Enterobacteriaceae in northern Portugal. Sci. World. J. 2014. https://doi:10.1155/2014/782897.

11. Bali E. B., Açık L., Sultan N. Phenotypic and molecular characterization of SHV produced by Escherichia coli, Acinobacter baumannii and Klebsiella isolates in a Turkish hospital. Afr. J. Microbiol. Res. 2010. Vol. 4. P. 650–654.

12. Jena J., Sahoo R. K., Debata N. K., Subudhi E. Prevalence of TEM, SHV, and CTX–M genes of extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli strains isolated from urinary tract infections in adults. 3 Biotech. 2017. Vol. 7. No. 4. P. 1–7. https:// doi:10.1007/s13205–017–0879–2.

13. Палагин И. С., Сухорукова М. В., Дехнич А. В. и соавт. Исследовательская группа «ДАРМИС». Современное состояние антибиотикорезистентности возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты исследования «ДАРМИС» (2010–2011). Клин. микробиол. антимикроб. химиотер. 2012. № 14 (4). С. 280–302.