Изменение генетического разнообразия ВИЧ‑1 среди мужчин, практикующих секс с мужчинами, проживающих в России в период 2004–2025 гг.

Введение. Исторически мужчины, практикующие секс с мужчинами (МСМ), являются стигматизированным сообществом в России, что негативно сказывается на профилактике ВИЧ-инфекции в этой уязвимой группе и осложняет исследование генетических вариантов ВИЧ‑1.

Целью нашего исследования была характеристика вариантов ВИЧ‑1, в образцах, полученных в 2004–2025 гг. от МСМ, проживающих в России.

Материалы и методы. Были проанализированы нуклеотидные последовательности фрагмента гена pol ВИЧ‑1 (2253–3369 н.п.) из баз данных RuHIV и GenBank от 562 ВИЧ-инфицированных МСМ, проживающих в РФ. Было проведено генотипирование, филогенетический и кластерный анализ и расчет p-дистанции среди наиболее часто встречаемых генетических вариантов ВИЧ‑1.

Результаты. К суб-субтипу A6 относились 44,84% образцов, к субтипу B – 35,94% образцов, причем доля ВИЧ‑1 суб-субтипа A6 статистически достоверно росла в период 2004–2025 гг. Был выявлен рост p-дистанции среди вирусов суб-субтипа A6 (с 0,044 до 0,054) и субтипа B (с 0,05 до 0,072) в 2004–2025 гг. Получены доказательства как размытия границ уязвимой группы МСМ, так и продолжающейся циркуляции субтипа B среди МСМ в России. Показано влияние миграции на увеличение числа случаев инфицирования редкими и рекомбинантными формами ВИЧ‑1 среди МСМ в России в последние годы.

Заключение. Показана важность исследования уязвимой группы МСМ для эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией в России. Выявлен вклад миграции в генетическое разнообразие вариантов ВИЧ‑1, циркулирующих в стране.

1. Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeters M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review. Infect. Genet. Evol. 2016; 46: 150–8. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2016.10.018.

2. Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д. Е. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ 1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. Тер. архив 2017; 89 (11): 44–9. https://doi.org/10.17116/terarkh2017891144–49.

3. Лаповок И.А., Кириченко А.А., Шлыкова А.В. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ генетических вариантов ВИЧ 1, циркулировавших в странах Восточной Европы и Центральной Азии в 2010–2019 гг. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2022; 12 (3): 31–40. (In Russ.). https://doi.org/10.18565/epidem.2022.12.3.31–40.

4. Baryshev P., Bogachev V., Gashnikova N. HIV 1 genetic diversity in Russia: CRF63_02A1, a new HIV type 1 genetic variant spreading in Siberia. AIDS Res. Hum. Retroviruses 2014; 30(6): 592–7. https://doi.org/10.1089/AID.2013.019.

5. Kostaki E.-G., Karamitros T., Bobkova M., et al. Spatiotemporal Characteristics of the HIV 1 CRF02_AG/CRF63_02A1 Epidemic in Russia and Central Asia. AIDS Res. Hum. Retroviruses 2018; 34(5): 415–20. https://doi.org/10.1089/AID.2017.0233.

6. Bobkova M. Current status of HIV 1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR. AIDS Rev. 2013;15(4):204–12. PMID: 24192601.

7. Kazennova E., Laga V., Gromov K., et al. Genetic Variants of HIV Type 1 in Men Who Have Sex with Men in Russia. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2017;33(10):1061–4. https://doi.org/10.1089/AID.2017.0078.

8. Лаповок И.А., Кириченко А.А., Шлыкова А.В. и др. Анализ генетических вариантов ВИЧ 1 среди мужчин-мигрантов гомосексуальной ориентации, проживающих в Москве. Журнал инфектологии. 2023; 15 (2 S2): 71–2. EDN: https://elibrary.ru/qtszlb.

9. Murzakova A., Kireev D., Baryshev P., et al. Molecular epidemiology of HIV 1 subtype G in the Russian Federation. Viruses. 2019; 11 (4): 348. https://doi.org/10.3390/v11040348.

10. Tamura K., Stecher G., Peterson D., et al. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Mol. Biol. Evol. 2013; 30 (12): 2725–9. https://doi.org/10.1093/molbev/mst197.

11. Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Васильев А.В. и др. Проблемы субтипирования ВИЧ 1 наоснове анализа гена pol и способы их разрешения. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2010; 2(3): 42–48. УДК: 577.156+616.9.

12. Shaw G.M., Hunter E. HIV transmission. Review. Cold Spring Harb Perspect Med. 2012; 2 (11): a006965. https://doi.org/10.1101/cshperspect.a006965.

13. Лукьяненко Н.В., Киреев Д.Е., Лаповок И.А. и др. Анализ заболеваемости ВИЧ-инфекцией в Алтайском крае в 2022 г. // Якутский медицинский журнал. 2024; 4 (88): 80–84. https://doi. org/10.25789/YMJ.2024.88.19.