medalphabetМедицинский алфавитMedical alphabet2078-56312949-2807ООО «Альфмед»10.33667/2078-5631-2021-30-57-60medalphabet-2300Research ArticleСОВРЕМЕННАЯ ЛАБОРАТОРИЯMODERN LABORATORYНосительство Streptococcus pneumoniae у детей школьного возрастаStreptococcus pneumoniae carriage in school childrenhttps://orcid.org/0000-0001-6521-8615ПротасоваИ. Н.ProtasovaI. N.

Протасова Ирина Николаевна, к. м. н., доцент кафедры микробиологии имени доцента Б. М. Зельмановича

Scopus Author ID: 57194856372

г. Красноярск

Protasova Irina N., PhD Med, associate professor at Dept of Microbiology n. a. associate professor B. M. Zelmanovich

Scopus Author ID: 57194856372

Krasnoyarsk

ovsyanka802@gmai.comhttps://orcid.org/0000-0003-2868-1509БахареваН. В.BakharevaN. V.

Бахарева Наталья Васильевна, консультант

г. Красноярск

Bakhareva Natalya V., consultant

Krasnoyarsk

bakhareva@kraszdrav.ruhttps://orcid.org/0000-0001-8058-7806ИльенковаН. А.IlyenkovaN. A.

Ильенкова Наталья Анатольевна, д. м. н., проф., зав. кафедрой детских болезней с курсом ПО

г. Красноярск

Ilyenkova Natalya A., DM Sci (habil.), professor, head of Dept of Childhood Diseases

Krasnoyarsk

ilenkova1@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-5351-5433СоколовскаяЕ. С.SokolovskayaE. S.

Соколовская Елена Сергеевна, соискатель кафедры детских болезней с курсом ПО

г. Красноярск

Sokolovskaya Elena S., applicant for Dept of Childhood Diseases

Krasnoyarsk

selenasergsokol@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-1969-5482ЕлистратоваТ. А.ElistratovaT. A.

Елистратова Татьяна Анатольевна, ассистент кафедры инфекционных болезней и эпидемиологии с курсом ПО

г. Красноярск

Elistratova Tatyana A., assistant of Dept of Infectious Diseases and Epidemiology

Krasnoyarsk

anna040208@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-1969-5482СульдинаА. Г.SuldinaA. G.

Сульдина Анна Геннадьевна, студентка 507-й группы педиатрического факультета

г. Красноярск

Suldina Anna G., student of the 507th group of Pediatric Faculty

Krasnoyarsk

asyra@inbox.ruФГБОУ ВО «Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В. Ф. Войно-Ясенецкого» Минздрава РоссииРоссияKrasnoyarsk State Medical University n. a. professor V. F. Voino-YasenetskyRussian FederationМинистерство здравоохранения Красноярского краяРоссияMinistry of Health of the Krasnoyarsk TerritoryRussian Federation202101122021130Современная лаборатория (2)5760Copyright © Протасова И.Н., Бахарева Н.В., Ильенкова Н.А., Соколовская Е.С., Елистратова Т.А., Сульдина А.Г., 20212021Протасова И.Н., Бахарева Н.В., Ильенкова Н.А., Соколовская Е.С., Елистратова Т.А., Сульдина А.Г.Protasova I.N., Bakhareva N.V., Ilyenkova N.A., Sokolovskaya E.S., Elistratova T.A., Suldina A.G.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.med-alphabet.com/jour/article/view/2300Цель исследования

Цель исследования. Изучение серотипового, клонального состава и чувствительности к антибактериальным препаратам пневмококков у детей школьного возраста.

Материалы и методы

Материалы и методы. В 2012–2018 годах обследовано 498 школьников в возрасте от 6 до 17 лет. У детей были взяты мазки из ротоглотки, проведено бактериологическое исследование с последующим генотипированием чистых культур и определением их чувствительности к антибиотикам.

Результаты

Результаты. Пневмококк был выявлен у 10,6% детей. Исследуемые штаммы относились к семи серотипам и семи серогруппам. Наиболее часто встречались S. pneumoniae 6-й серогруппы и серотипа 19F (по 15,1%), 9-й серогруппы (13,2%). С меньшей частотой встречались пневмококки 33FA/37 и 3 (9,4 и 5,7%), представители серогрупп 15 и 18 (7,6 и 5,7%), серотипа 10А (3,8%). Выделенные культуры принадлежали к 20 сиквенс-типам, относящимся к 14 клональным комплексам (СС); преобладающими являлись CC156, CC447 и CC320. У 1,9% штаммов выявлена резистентность к пенициллину, у 13,2% – к макролидам, клиндамицину и тетрациклину. Устойчивые к антибиотикам пневмококки относились к глобальным мультирезистентным клональным комплексам 320, 315 и 156.

Выводы

Выводы. Распространенность S. pneumoniae среди детей школьного возраста невысока. Популяция пневмококков характеризуется серотиповым и клональным разнообразием, в том числе присутствием «инвазивных» серотипов и генотипов. Большинство штаммов сохраняют чувствительность к антибактериальным препаратам.

Purpose

Purpose. To investigate the serotype distribution, clonal structure and antimicrobial resistance of pneumococci isolated from schoolchildren.

Materials and methods

Materials and methods. During the period from 2012 to 2018 we examined 498 healthy school children aged 6 to 17 years. Oropharyngeal swab was taken from each child for culture, after that all S. pneumoniae strains were genotyped for serotype and ST-type deduction (PCR and sequencing, respectively). Antimicrobial resistance was also determined.

Results

Results. Pneumococcal culture was positive in 10.6 % of children. S. pneumoniae isolates belonged to seven serogroups and seven serotypes. Serogroup 6 and serotype 19F strains (15.1% each), and serogroup 9 strains (13.2%) were the most prevalent. S. pneumoniae33FA/37 and 3 (9.4 and 5.7%), serogroups 15 and 18 (7.6 and 5.7%), and 10A serotype (3.8%) were determined at a lower frequency. 20 detected ST-types belonged to 14 clonal complexes (CCs); CC156, CC447, and CC320 were predominant. 1.9% of isolates were penicillin-resistant; 13.2% – macrolide-, clindamycin-, and tetracycline-resistant. S. pneumoniae antibiotic resistant strains belonged to multidrug-resistant CCs 320, 315, and 156.

Conclusion

Conclusion. S. pneumoniae prevalence in school children is not high. Pneumococcal population is characterized by serotype and clonal diversity including ‘invasive’ serotypes and genotypes. Most of strains are susceptible to antimicrobials.

Streptococcus pneumoniaeпневмококкносительствосеротипысиквенс-типырезистентностьдети школьного возрастаStreptococcus pneumoniaepneumococcuscarriageserotypessequence-typesresistanceschool childrenReferencesBriles D.E., Paton J.C., Mukerji R., Swiatlo E., Crain M.J. Pneumococcal vaccines. Microbiology Spectrum. 2019. Vol. 7, No. 6. DOI: 10.1128/microbiolspec.GPP3–0028–2018.Briles D.E., Paton J.C., Mukerji R., Swiatlo E., Crain M.J. Pneumococcal vaccines. Microbiology Spectrum. 2019. Vol. 7, No. 6. DOI: 10.1128/microbiolspec.GPP3–0028–2018.Górska-Kot A., Greenberg D., Gastoł K., Zieliński A., Givon-Lavi N. Characterization of acute otitis media otopathogens before the introduction of the pneumococcal conjugated vaccine into the national immunization program in Poland. International journal of pediatric otorhinolaryngology. 2019. Vol. 127: 109666. DOI: 10.1016/j.ijporl.2019.109666.Górska-Kot A., Greenberg D., Gastoł K., Zieliński A., Givon-Lavi N. Characterization of acute otitis media otopathogens before the introduction of the pneumococcal conjugated vaccine into the national immunization program in Poland. International journal of pediatric otorhinolaryngology. 2019. Vol. 127: 109666. DOI: 10.1016/j.ijporl.2019.109666.Touhami K.O., Sakkali H.E.B., Maaloum F., Diawara I., Touhami M. O., Bezzari M., Zerouali K., Belabbes H. Meningitis caused by Streptococcus pneumoniae serotype 7a in an infant vaccinated with two doses of 13-valent pneumococcal conjugate vaccine: a case study. The Pan African Medical Journal. 2019. Vol. 32: 203. DOI: 10.11604/pamj.2019.32.203.18157.Touhami K.O., Sakkali H.E.B., Maaloum F., Diawara I., Touhami M. O., Bezzari M., Zerouali K., Belabbes H. Meningitis caused by Streptococcus pneumoniae serotype 7a in an infant vaccinated with two doses of 13-valent pneumococcal conjugate vaccine: a case study. The Pan African Medical Journal. 2019. Vol. 32: 203. DOI: 10.11604/pamj.2019.32.203.18157.Красноярский краевой медицинский информационно-аналитический центр. Медbко-статистическая информация [интернет-ресурс]. https://www.kmiac.ru/statistics/? ELEMENT_ID=125 (дата обращения: 09.01.2020).Krasnoyarsk Regional Medical Information and Analytical Center. Medical and statistical information [Internet resource]. https://www.kmiac.ru/statistics/? ELEMENT_ID=125 (date of access: 09/01/2020).Министерство здравоохранения Российской Федерации. Статистические материалы [интернет-ресурс]. https://www.rosminzdrav.ru/ministry/61/22/stranitsa-979/statisticheskie-i-informatsionnyematerialy/statisticheskie-materialy (дата обращения: 09.01.2020).Ministry of Health of the Russian Federation. Statistical materials [Internet resource]. https://www.rosminzdrav.ru/ministry/61/22/stranitsa-979/statisticheskie-i-informatsionnye-materialy/statisticheskie-materialy (date of access: 09/01/2020).Артюхов И.П., Галактионова М.Ю., Рахимова А.Л. Основные тенденции состояния здоровья подростков города Красноярска. Сибирское медицинское обозрение. 2012. № 6. C. 47–52.Artyukhov I.P., Galaktionova M. Yu., Rakhimova A.L. The main trends in the state of health of adolescents in the city of Krasnoyarsk. Siberian Medical Review. 2012. No. 6. P. 47–52.Weiser J.N., Ferreira D.M., Paton J.C. Streptococcus pneumoniae: transmission, colonization and invasion. Nature Reviews. Microbiology. 2018. Vol. 16, No. 6. P. 355–367. DOI: 10.1038/s41579–018–0001–8.Weiser J.N., Ferreira D.M., Paton J.C. Streptococcus pneumoniae: transmission, colonization and invasion. Nature Reviews. Microbiology. 2018. Vol. 16, No. 6. P. 355–367. DOI: 10.1038/s41579–018–0001–8.Маркова В. Новые возможности вакцинопрофилактики пневмококковой инфекции у детей раннего возраста. Эффективная фармакотерапия в педиатрии. 2009. № 1. С. 50–59.Markova V. New opportunities for vaccine prevention of pneumococcal infection in young children. Effective pharmacotherapy in pediatrics. 2009. No. 1. P. 50–59.Le Polain de Waroux O., Flasche S., Prieto-Merino D., Edmunds W. J. Age-dependent prevalence of nasopharyngeal carriage of streptococcus pneumoniae before conjugate vaccine introduction: a prediction model based on a meta-analysis. PLoS One. 2014. Vol. 9, No. 1: e86136. DOI: 10.1371/journal.pone.0086136.Le Polain de Waroux O., Flasche S., Prieto-Merino D., Edmunds W. J. Age-dependent prevalence of nasopharyngeal carriage of streptococcus pneumoniae before conjugate vaccine introduction: a prediction model based on a meta-analysis. PLoS One. 2014. Vol. 9, No. 1: e86136. DOI: 10.1371/journal.pone.0086136.bioMerieux SA. Etest Application Guide [интернет-ресурс]. https://www.biomerieux-usa. com/sites/subsidiary_us/files/supplementary_inserts_-_16273_-_b_-_en_-_eag_-_etest_application_guide-3.pdf (date of access: 09.01.2020).bioMerieux SA. Etest Application Guide [интернет-ресурс]. https://www.biomerieux-usa. com/sites/subsidiary_us/files/supplementary_inserts_-_16273_-_b_-_en_-_eag_-_etest_application_guide-3.pdf (date of access: 09.01.2020).Межрегиональная ассоциация по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии. Клинические рекомендации «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам» [интернет-ресурс]. http://www.antibiotic.ru/minzdrav/fles/docs/clrec-dsma2018.pdf (дата обращения: 09.01.2020).Interregional Association for Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. Clinical guidelines “Determination of the sensitivity of microorganisms to antimicrobial drugs” [Internet resource]. http://www.antibiotic.ru/minzdrav/fles/docs/clrec-dsma2018.pdf (date of access: 09/01/2020).Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. Москва: Мир, 1984. 480 с.Maniatis T., Fritsch E., Sambrook D. Methods of genetic engineering. Molecular Cloning. Moscow: Mir, 1984. 480 p.Centers for disease control and prevention. Conventional PCR deduction of 40 pneumococcal serotypes or serogroups [интернет-ресурс]. https://www.cdc.gov/streplab/downloads/pcr-oligonucleotide-primers.pdf (дата обращения: 09.01.2020).Centers for disease control and prevention. Conventional PCR deduction of 40 pneumococcal serotypes or serogroups [интернет-ресурс]. https://www.cdc.gov/streplab/downloads/pcr-oligonucleotide-primers.pdf (дата обращения: 09.01.2020).Public databases for molecular typing and microbial genome diversity. Primers and PCR conditions for MLST of S. pneumoniae [интернет-ресурс]. https://pubmlst.org/spneumoniae/info/primers.shtml (дата обращения: 09.01.2020).Public databases for molecular typing and microbial genome diversity. Primers and PCR conditions for MLST of S. pneumoniae [интернет-ресурс]. https://pubmlst.org/spneumoniae/info/primers.shtml (дата обращения: 09.01.2020).Global optimal eBURST [интернет-ресурс]. http://www.phyloviz.net/goeburst/#Description (дата обращения: 09.01.2020).Global optimal eBURST [интернет-ресурс]. http://www.phyloviz.net/goeburst/#Description (дата обращения: 09.01.2020).del Amo E., Esteva C., Hernandez-Bou S., Galles C., Navarro M., Sauca G., Diaz A., Gassiot P., Marti C., Larossa N., Ciruela P., Jane M., Sá-Leão R., Muñoz-Almagro K. Serotypes and clonal diversity of Streptococcus pneumoniae causing invasive disease in the era of PCV13 in Catalonia, Spain. PLoS One 2016. Vol. 11, No. 3: e0151125. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0151125.del Amo E., Esteva C., Hernandez-Bou S., Galles C., Navarro M., Sauca G., Diaz A., Gassiot P., Marti C., Larossa N., Ciruela P., Jane M., Sá-Leão R., Muñoz-Almagro K. Serotypes and clonal diversity of Streptococcus pneumoniae causing invasive disease in the era of PCV13 in Catalonia, Spain. PLoS One 2016. Vol. 11, No. 3: e0151125. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0151125.Golden A. R., Adam H. J., Karlowsky J. A., Baxter M., Nichol K. A., Martin I., Demczuk W., Van Caeseele P., Gubbay J.B., Lefebvre B., Levett P.N., Zahariadis G., Haldane D., Gad R., German G., Gilmour M. W., Mulvey M. R., Hoban D. J., Zhanel G. G., the Canadian Antimicrobial Resistance Alliance (CARA). Molecular characterization of predominant Streptococcus pneumoniae serotypes causing invasive infections in Canada: the SAVE study, 2011–15. Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 2018. Vol. 73, No. 7. P. vii 20–vii31. https://doi.org/10.1093/jac/dky157.Golden A. R., Adam H. J., Karlowsky J. A., Baxter M., Nichol K. A., Martin I., Demczuk W., Van Caeseele P., Gubbay J.B., Lefebvre B., Levett P.N., Zahariadis G., Haldane D., Gad R., German G., Gilmour M. W., Mulvey M. R., Hoban D. J., Zhanel G. G., the Canadian Antimicrobial Resistance Alliance (CARA). Molecular characterization of predominant Streptococcus pneumoniae serotypes causing invasive infections in Canada: the SAVE study, 2011–15. Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 2018. Vol. 73, No. 7. P. vii 20–vii31. https://doi.org/10.1093/jac/dky157.Public databases for molecular typing and microbial genome diversity. Streptococcus pneumoniae isolates database [интернет-ресурс]. https://pubmlst.org/bigsdb?db=pubmlst_spneumoniae_isolates (дата обращения: 10.01.2020).Public databases for molecular typing and microbial genome diversity. Streptococcus pneumoniae isolates database [интернет-ресурс]. https://pubmlst.org/bigsdb?db=pubmlst_spneumoniae_isolates (дата обращения: 10.01.2020).Pneumococcal Molecular Epidemiology Network. Clone collection [интернет-ресурс]. https://www.pneumogen.net/pmen/clone-collection.html (дата обращения: 10.01.2020).Pneumococcal Molecular Epidemiology Network. Clone collection [интернет-ресурс]. https://www.pneumogen.net/pmen/clone-collection.html (дата обращения: 10.01.2020).Протасова И. Н., Бахарева Н. В., Перьянова О. В., Ильенкова Н. А., Мартынова Г. П., Домрачева С. В., Овчинникова О. П., Елистратова Т. А., Тюшевская О. А., Соколовская Е.С., Сидоренко С.В., Yamamoto T. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика и резистентность пневмококков у детей дошкольного возраста. Сибирское медицинское обозрение. 2018, № 3. С. 73–79.Protasova I. N., Bakhareva N. V., Perianova O. V., Ilyenkova N. A., Martynova G. P., Domracheva S.V., Ovchinnikova O.P., Elistratova T.A., Tyushevskaya O A.A., Sokolovskaya E.S., Sidorenko S.V., Yamamoto T. Molecular epidemiological characteristics and resistance of pneumococci in preschool children. Siberian Medical Review. 2018, No. 3. P. 73–79.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.