medalphabetМедицинский алфавитMedical alphabet2078-56312949-2807ООО «Альфмед»10.33667/2078-5631-2021-18-12-15medalphabet-2138Research ArticleСтатьиПрофили и генетические детерминанты антибиотикорезистентности возбудителей внебольничных инфекций мочевыводящих путей у женщин репродуктивного возрастаProfiles and genetic determinants of antimicrobial resistance in pathogens causing community-acquired urinary tract infections in reproductive-age womenhttps://orcid.org/0000-0002-2742-2655ХуснутдиноваТ. А.KhusnutdinovaT. A.

Хуснутдинова Татьяна Алексеевна, научный сотрудник группы экспериментальной микробиологии, ассистент кафедры клинической лабораторной диагностики ФП и ДПО

ID researcher: K‑1852–2018

Scopus: 57015542400

Санкт-Петербург

Khusnutdinova Tatiana A., researcher of Experimental Microbiology Group, assistant at Dept of Clinical Laboratory Diagnostics

ID researcher: K‑1852–2018

Scopus: 57015542400

Saint Petersburg

husnutdinovat@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0002-2309-3604ШипицынаЕ. В.ShipitsynaE. V.

Шипицына Елена Васильевна, д. б. н., вед. н. с. группы экспериментальноймикробиологии

ID researcher: K‑1271–2018

Scopus: 14071984800

Санкт-Петербург

Shipitsyna Elena V., PhD Med, leading researcher of Experimental Microbiology Group

ID researcher: K‑1271–2018

Scopus: 14071984800

Saint Petersburg

shipitsyna@inbox.ruhttps://orcid.org/0000-0003-4798-1881КрысановаА. А.KrysanovaA. A.

Крысанова Анна Александровна, н. с. группы экспериментальной микробиологии, ассистент кафедры клинической лабораторной диагностики ФП и ДПО

ID researcher: K‑3678–2018

Scopus: 57199643089

Санкт-Петербург

Krysanova Anna A., researcher of Experimental Microbiology Group1, assistant at Dept of Clinical Laboratory Diagnostics

ID researcher: K‑3678–2018

Scopus: 57199643089

Saint Petersburg

krusanova.anna@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3870-5930СавичеваА. М.SavichevaA. M.

Савичева Алевтина Михайловна, д. м. н., проф., заслуженный деятель науки РФ, зав. отделом медицинской микробиологии, зав. кафедрой клинической лабораторной диагностики ФП и ДПО

ID researcher: P‑6788–2015

Scopus: 6602838765

Санкт-Петербург

Savicheva Alevtina M., DM Sci, prof., head of Dept of Medical Microbiology, head of the Dept of Clinical Laboratory Diagnostics

ID researcher: P‑6788–2015

Scopus: 6602838765

Saint Petersburg

savitcheva@mail.ruФГБНУ «НИИ акушерства, гинекологии и репродуктологии имени Д. О. Отта»; ФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет» Минздрава РоссииРоссияResearch Institute for Obstetrics, Gynecology and Reproductology n. a. D. O. Ott; Saint Petersburg State Pediatric Medical UniversityRussian FederationФГБНУ «НИИ акушерства, гинекологии и репродуктологии имени Д. О. Отта»РоссияResearch Institute for Obstetrics, Gynecology and Reproductology n. a. D. O. OttRussian Federation202118082021018Эпидемиология, гигиена, инфекционные болезни (1)1215Copyright © Хуснутдинова Т.А., Шипицына Е.В., Крысанова А.А., Савичева А.М., 20212021Хуснутдинова Т.А., Шипицына Е.В., Крысанова А.А., Савичева А.М.Khusnutdinova T.A., Shipitsyna E.V., Krysanova A.A., Savicheva A.M.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.med-alphabet.com/jour/article/view/2138

Цель исследования. Определить профили и генетические детерминанты антибиотикорезистентности возбудителей внебольничных инфекций мочевыводящих путей (ИМП) у женщин репродуктивного возраста в Санкт-Петербурге.Материалы и методы. В исследование были включены штаммы микроорганизмов, полученные от 145 женщин репродуктивного возраста с диагнозом ИМП. Чувствительность к антибиотикам исследовали диско-диффузионным методом, интерпретацию результатов осуществляли в соответствии критериями EUCAST. Штаммы уропатогенных энтеробактерий были протестированы методом ПЦР на наличие генов бета-лактамаз: гены бета-лактамаз, кодирующих ферменты группы AmpC (MOX, CMY, LAT, BIL, DHA, ACC, MIR, ACT, FOX), TEM, SHV, OXA-1, генов БЛРС группы CTX–M, генов карбапенемаз (KPC, OXA‑48) и металло-бета-лактамаз (VIM, IMP, NDM).Результаты. Большинство (81 %) случаев ИМП у женщин в Санкт-Петербурге были обусловлены энтеробактериями с подавляющим доминированием Escherichia coli (66 %). Фосфомицин, меропенем и нитрофурантоин имели самую высокую in vitro активность против уропатогенных энтеробактерий. Были отмечены высокие показатели резистентности к бета-лактамным антибиотикам (от 16 % к цефотаксиму до 28 % к амоксициллин / клавулановой кислоте). Гены ТЕМ-бета-лактамаз были обнаружены в 31 изоляте (26,7 %), SHV – в 17 (14,6 %), СТХ–М типа – в 15 (12,9 %), гена DHA – в 2 (1,7 %). Остальные гены бета-лактамной резистентности (MOX, CMY, LAT, BIL, ACC, MIR, ACT, FOX, группа KPC, группа OXA-подобных, VIM, IMP, NDM) не были выявлены.Заключение. Микробиологический и молекулярный анализ структуры бета-лактамной резистентности имеет ключевое значение для эффективного эпидемиологического контроля устойчивости возбудителей инфекций мочевыводящих путей к антибактериальным препаратам.

Objective. To characterize the profiles and genetic determinants of antibiotic resistance in pathogens of community-acquired urinary tract infections (UTI) in women of reproductive age in St. Petersburg (Russia).Materials and methods. The study included strains of microorganisms obtained from 145 women of reproductive age with diagnosed with a UTI. Antibiotic susceptibility was evaluated by disk diffusion method; the interpretation of the results was carried out in accordance with the EUCAST criteria. Strains of uropathogenic enterobacteria were tested by PCR for the presence of beta-lactamase genes: beta-lactamase genes encoding enzymes of the AmpC group (MOX, CMY, LAT, BIL, DHA, ACC, MIR, ACT, FOX), TEM, SHV, OXA‑1, ESBL genes of the CTX–M group, genes of carbapenemases (KPC, OXA‑48) and metal-beta-lactamases (VIM, IMP, NDM).Results. Most cases (81 %) of UTIs in women in St. Petersburg were due to enterobacteria, with Escherichia coli highly prevailing (66 %). Fosfomycin, meropenem and nitrofurantoin had the highest in vitro activity against uropathogenic Enterobacteriaceae. High rates of resistance to betalactam antibiotics were found (from 16 % to cefotaxime to 28 % to amoxicillin/clavulanic acid). The genes of TEM-beta-lactamases were found in 31 isolates (26.7 %), SHV – in 17 (14.6 %), CTX–M type – in 15 (12.9 %), DHA – in 2 (1.7 %). The other beta-lactam resistance genes (MOX, CMY, LAT, BIL, ACC, MIR, ACT, FOX, KPC group, OXA-like group, VIM, IMP, NDM) were not detected.Conclusion. Microbiological and molecular analysis of the structure of beta-lactam resistance is important for the effective of epidemiological control of antimicrobial resistance in pathogens causing urinary tract infections.

инфекции мочевыводящих путейуропатогенные энтеробактерииантибиотикорезистентностьгены бета-лактамазurinary tract infectionsuropathogenic enterobacteriaantibiotic resistancebeta-lactamase genesИсследование выполнено в рамках поисковой научной темы «Определение клинически значимой бактериурии и детерминант антибиотикорезистентности возбудителей инфекций мочевыводящих путей у беременных женщин с применением молекулярно-биологических методов». Номер госрегистрации: АААА-А20–120041390029–7.ReferencesFlores-Mireles A.L., Walker J. N., Caparon M., Hultgren S. J. Urinary tract infections: epidemiology, mechanisms of infection and treatment options. Nat. Rev. Microbiol. 2015. Vol. 13. P. 269–284. https://doi:10.1038/nrmicro3432.Flores-Mireles A.L., Walker J. N., Caparon M., Hultgren S. J. Urinary tract infections: epidemiology, mechanisms of infection and treatment options. Nat. Rev. Microbiol. 2015. Vol. 13. P. 269–284. https://doi:10.1038/nrmicro3432.Ruppé E., Woerther P. L., Barbier F. Mechanisms of antimicrobial resistance in Gram-negative bacilli. Ann. Intensive Care. 2015. Vol. 5. No. 1. P. 61. https://doi:10.1186/s13613-015-0061-0.Ruppé E., Woerther P. L., Barbier F. Mechanisms of antimicrobial resistance in Gram-negative bacilli. Ann. Intensive Care. 2015. Vol. 5. No. 1. P. 61. https://doi:10.1186/s13613-015-0061-0.Сидоренко С. В., Березин А. Г., Иванов Д. В. Молекулярные механизмы устойчивости грамотрицательных бактерий семейства Enterobacteriaceae к цефалоспориновым антибиотикам/ Антибиотики и химиотерапия. 2004. Т. 49. № 3. С. 6–16.Sidorenko S. V., Berezin A. G., Ivanov D. V. Molecular mechanisms of cephalosporins resistance in gramnegative bacteria of the Enterobacteriaceae family. Antibiotiki i chimioterapiya. 2004; 49 (3): 6–16. (In Russ.)Dallenne C., da Costa A., Decré D., Favier C., Arlet G. Development of a set of multiplex PCR assays for the detection of genes encoding important β-lactamases in Enterobacteriaceae. J. Antimicrob. Chemother. 2010. Vol. 65. P. 490–495. https://doi:10.1093/jac/dkp498.Dallenne C., da Costa A., Decré D., Favier C., Arlet G. Development of a set of multiplex PCR assays for the detection of genes encoding important β-lactamases in Enterobacteriaceae. J. Antimicrob. Chemother. 2010. Vol. 65. P. 490–495. https://doi:10.1093/jac/dkp498.Olesen I., Hasman H., Aarestrup F. M. Prevalence of beta-lactamases among ampicillin-resistant Escherichia coli and Salmonella isolated from food animals in Denmark. Microb. Drug Resist. 2004. Vol. 10. No. 4. P. 334–340. https://doi:10.1089/mdr.2004.10.334.Olesen I., Hasman H., Aarestrup F. M. Prevalence of beta-lactamases among ampicillin-resistant Escherichia coli and Salmonella isolated from food animals in Denmark. Microb. Drug Resist. 2004. Vol. 10. No. 4. P. 334–340. https://doi:10.1089/mdr.2004.10.334.Pérez-Pérez F.J., Hanson N. D. Detection of plasmid-mediated AmpC β-lactamase genes in clinical isolates by using multiplex PCR. J. Clin. Microbiol. 2002. Vol. 40. No. 6. P. 2153–2162. https://doi:10.1128/jcm.40.6.2153–2162.2002.Pérez-Pérez F.J., Hanson N. D. Detection of plasmid-mediated AmpC β-lactamase genes in clinical isolates by using multiplex PCR. J. Clin. Microbiol. 2002. Vol. 40. No. 6. P. 2153–2162. https://doi:10.1128/jcm.40.6.2153–2162.2002.Палагин И. С., Сухорукова М. В., Дехнич А. В., Эйдельштейн М. В., Перепанова Т. С., Козлов Р. С. и исследовательская группа «ДАРМИС‑2018». Антибиотикорезистентность возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты многоцентрового исследования «ДАРМИС‑2018». Клин. микробиол. антимикроб. химиотерапия. 2019. Т. 21. № 2. С. 134–146. https://doi:10.36488/cmac.2019.2.134-146.Palagin I. S., Sukhorukova M.V, Dekhnich A. V., Edelstein M. V., Perepanova T. S., Kozlov R. S. and “DARMIS‑2018” Study Group. Antimicrobial resistance of pathogens causing community- acquired urinary tract infections in Russia: results of multicenter study «DARMIS‑2018». Klinichescheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya himioterapiya. 2019; 21 (2): 134–146. https://doi:10.36488/cmac.2019.2.134-146. (In Russ.)Ny S., Edquist P., Dumpis U. [et al.] Antimicrobial resistance of Escherichia coli isolates from outpatient urinary tract infections in women in six European countries including Russia. J. Glob. Antimicrob. Resist. 2019. Vol. 17. P. 25–34. https://doi:10.1016/j.jgar.2018.11.004.Ny S., Edquist P., Dumpis U. [et al.] Antimicrobial resistance of Escherichia coli isolates from outpatient urinary tract infections in women in six European countries including Russia. J. Glob. Antimicrob. Resist. 2019. Vol. 17. P. 25–34. https://doi:10.1016/j.jgar.2018.11.004.Carattoli A., García-Fernández A., Varesi P. [et al.] Molecular epidemiology of Escherichia coli producing extended-spectrum β-lactamases isolated in Rome, Italy. J. Clin. Microbiol. 2008. Vol. 46. P. 103–108. https://doi:10.1128/JCM.01542-07Carattoli A., García-Fernández A., Varesi P. [et al.] Molecular epidemiology of Escherichia coli producing extended-spectrum β-lactamases isolated in Rome, Italy. J. Clin. Microbiol. 2008. Vol. 46. P. 103–108. https://doi:10.1128/JCM.01542-07Fernandes R., Amador P., Oliveira C., Prudêncio C. Molecular characterization of ESBL- producing Enterobacteriaceae in northern Portugal. Sci. World. J. 2014. https://doi:10.1155/2014/782897.Fernandes R., Amador P., Oliveira C., Prudêncio C. Molecular characterization of ESBL- producing Enterobacteriaceae in northern Portugal. Sci. World. J. 2014. https://doi:10.1155/2014/782897.Bali E. B., Açık L., Sultan N. Phenotypic and molecular characterization of SHV produced by Escherichia coli, Acinobacter baumannii and Klebsiella isolates in a Turkish hospital. Afr. J. Microbiol. Res. 2010. Vol. 4. P. 650–654.Bali E. B., Açık L., Sultan N. Phenotypic and molecular characterization of SHV produced by Escherichia coli, Acinobacter baumannii and Klebsiella isolates in a Turkish hospital. Afr. J. Microbiol. Res. 2010. Vol. 4. P. 650–654.Jena J., Sahoo R. K., Debata N. K., Subudhi E. Prevalence of TEM, SHV, and CTX–M genes of extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli strains isolated from urinary tract infections in adults. 3 Biotech. 2017. Vol. 7. No. 4. P. 1–7. https:// doi:10.1007/s13205–017–0879–2.Jena J., Sahoo R. K., Debata N. K., Subudhi E. Prevalence of TEM, SHV, and CTX–M genes of extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli strains isolated from urinary tract infections in adults. 3 Biotech. 2017. Vol. 7. No. 4. P. 1–7. https:// doi:10.1007/s13205–017–0879–2.Палагин И. С., Сухорукова М. В., Дехнич А. В. и соавт. Исследовательская группа «ДАРМИС». Современное состояние антибиотикорезистентности возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты исследования «ДАРМИС» (2010–2011). Клин. микробиол. антимикроб. химиотер. 2012. № 14 (4). С. 280–302.Palagin I. S., Sukhorukova M.V, Dekhnich A. V. et al. DARMIS Study Group. Current state of antibiotic resistance of pathogens causing community-acquired urinary tract infections in Russia: «DARMIS» study (2010–2011). Klinichescheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya himioterapiya. 2012; 14(4): 280–302. (In Russ.)

The authors declare that there are no conflicts of interest present.